Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Psmb9P28076 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms