Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BrafP28028 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BrafP28028 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BrafP28028 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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