Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lef1P27782 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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