Protein–RNA interactions for Protein: P27699

Crem, cAMP-responsive element modulator, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CremP27699 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CremP27699 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CremP27699 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CremP27699 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CremP27699 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CremP27699 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CremP27699 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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CremP27699 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CremP27699 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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CremP27699 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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CremP27699 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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CremP27699 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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CremP27699 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CremP27699 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CremP27699 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CremP27699 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CremP27699 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CremP27699 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CremP27699 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CremP27699 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CremP27699 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms