Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afxP27661 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms