Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms