Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms