Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd8P23463 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms