Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms