Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc2P20801 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms