Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prim1P20664 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prim1P20664 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms