Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms