Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a2P20490 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a2P20490 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms