Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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NelfeP19426 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms