Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms