Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RargP18911 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RargP18911 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RargP18911 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RargP18911 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms