Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl9P18340 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl9P18340 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms