Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spi1P17433 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spi1P17433 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms