Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms