Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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