Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgbP16014 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgbP16014 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgbP16014 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChgbP16014 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgbP16014 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgbP16014 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgbP16014 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgbP16014 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChgbP16014 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgbP16014 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChgbP16014 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms