Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rag1P15919 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms