Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms