Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx1P13297 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx1P13297 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx1P13297 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx1P13297 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms