Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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OtcP11725 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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OtcP11725 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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OtcP11725 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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OtcP11725 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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OtcP11725 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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