Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp1P11438 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms