Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms