Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Dnmt3cP0DOY1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms