Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Becn2P0DM65 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms