Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms