Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms