Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb5P09079 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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