Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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