Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06324 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06324 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06324 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06324 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06324 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06324 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06324 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06324 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06324 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06324 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06324 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06324 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06324 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06324 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms