Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrbP05622 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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