Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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