Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tk1P04184 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms