Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53P02340 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53P02340 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53P02340 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53P02340 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53P02340 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53P02340 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tp53P02340 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53P02340 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms