Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01740 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01740 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01740 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01740 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01740 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01740 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01740 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms