Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01652 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01652 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01652 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01652 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01652 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms