Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnpda1O88958 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms