Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
F11rO88792 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
F11rO88792 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
F11rO88792 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
F11rO88792 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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F11rO88792 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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F11rO88792 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
F11rO88792 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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