Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClppO88696 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClppO88696 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClppO88696 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClppO88696 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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