Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms