Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms