Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntfrO88507 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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