Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AurkcO88445 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AurkcO88445 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms