Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms