Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp4O70480 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms