Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna4O70174 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms